L'ús d'aliments modificats genèticament és una qüestió que genera controvèrsia. Hi ha qui hi veu perills per a l'evolució natural de les espècies i, fins i tot, per als humans. No és el cas d'en Josep Maria Mainat, que ha explicat per què n'és partidari. Per exemple, en Josep Maria considera que amb els aliments transgènics es podria acabar amb les problemàtiques de salut que pateixen molts infants en alguns països en vies de desenvolupament.